美国陆军航空兵的轰炸机从航空母舰起飞

未能参加珊瑚海战役和中途岛战役，是哈尔西引为遗憾的。珊瑚海战役发生之时，哈尔西正在赶往战区的途中；中途岛战役之前，哈尔西因患皮肤病而被迫住院治疗。　　1942年10月中旬，瓜达卡纳尔岛战事对美军极为不利，登陆美军面临被日军赶下大海的危险。尼米兹任命哈尔西赴努美阿取代戈姆利出任南太平洋战区最高司令（兼第3舰队司令），指挥该区的盟国陆海空三军，以扭转战局。　　根据侦察机获得的情报，哈尔西判断日军即将发动总攻，便设法加强该岛的海军陆战队，部署舰队迎战。10月24日，日军总攻开始，登陆美军则顽强据守，多次击退日军的进攻。26日，哈尔西所辖的第16特混舰队和第17特混舰队与日本联合舰队在圣克鲁斯岛海域交战，美国海军遭到战术性失利，损失1艘航空母舰和74架飞机，日本则有2艘航空母舰受创共损失100架飞机，但是，太平洋舰队司令部认为“瓜达卡纳尔岛总的形势并非不利”，因为联合舰队舰载机飞行员损失严重。趁日本联合舰队撤回特鲁克岛接受补给的机会，哈尔西加紧为海军陆战队赶运增援力量。

哈尔西视瓜达卡纳尔岛战役为南太平洋战区战役的关键，于11月8日飞抵该岛的亨德森机场视察，提出“杀死日本佬!杀死日本佬!杀死更多的日本佬!”的口号鼓舞守军。11月14日，美国海军在哈尔西指挥下向日本运输舰队发起反击。次日，在瓜达卡纳尔岛海域的战列舰交战中，日方损失2艘战列舰、1艘重型巡洋舰、3艘驱逐舰、11艘运输舰和数十架飞机。损失惨重的联合舰队再也不愿支援陆军作战。1943年2月，瓜达卡纳尔岛日军被迫撤离。罗斯福总统为瓜达卡纳尔岛战役的胜利而向哈尔西发出贺电。哈尔西随后晋升为海军上将。　　此后，日军在哈尔西的战区接连受挫。就在这时，太平洋舰队情报处破译了联合舰队司令长官山本五十六将飞抵布干维尔岛视察的情报。罗斯福和海军首脑人物决定击落山本座机。4月17日，哈尔西奉命组织这次“复仇”伏击行动，由18架P—38战斗机在预定的时间和地点执行。次日清晨，美国战斗机低空飞至预定空域后拉向高空。当山本乘坐的轰炸机在6架零式战斗机护航下出现时，美国飞机从高空直扑目标，以12架战斗机引开6架护航机，以6架战斗机将2架轰炸机击落，山本毙命。　　1943年5月，盟国的“三叉戟会议”决定实施“双叉冲击”

，从中太平洋和西南太平洋同时向日军发起进攻。哈尔西奉命组织指挥所罗门群岛战役。第3舰队得到加强，计有6艘航空母舰（舰载机540余架）、2艘战列舰、49艘巡洋舰和驱逐舰，还配属有海军陆战队。　　6月30日，哈尔西部在新乔治亚岛实施登陆作战，遭到日本守军的激烈抵抗。海战速度的加快促使哈尔西更换陆战指挥官。8月25日，美军攻克该岛，歼敌约9000人。　　根据预定计划，哈尔西的攻击目标将是科隆班格拉岛。该岛有1万日军严密设防，强攻不仅会造成重大伤亡，而且将使作战旷日持久，因此，哈尔西决定对该岛围而不攻，越过该岛而攻取韦拉拉维拉岛，为后来尼米兹提出“越岛作战”提供了成功的先例。