根据蒋介石的授意，陈果夫与吴稚晖冥思苦想，绞尽脑汁，终于制造出一个所谓“中国国民党中央监察委员吴敬恒呈中央监察委员会文”。该文盗用国民党中央监察委员会名义，伪造了所谓“中国国民党中央监察委员会在上海开会记录”，将4月2日的秘密会议冒称为中央监察委员会全体紧急会议”，公推“根本没有出席的蔡元培为会议主席，把到会的中监委人数仅占全体中监委的1/4说成是2/3。 该呈文诬称：“现在汉口中央执行委员会，为共产党及附和共产党之各员奉俄国共产党鲍罗廷煽动而盘踞”，“今者共产党有谋逆之整备，遂喧腾其联共之口号，诬罔总理，挟制舆论以图大逞……”因此，“举凡执行委员会内叛逆有据之共产党员及附逆委员，应予查办。未便尚听其行使职权，恣为颠倒”。呈文后还附有包括鲍罗廷、陈独秀、林祖涵、谭平山等在内的197人的名单，要求：“姑将所开各人及各地共产党首要危险分子，经党部举发者，就近知照公安局或军警，暂时分别看管监视，免致活动，致酿成不及阻止之叛乱行为……”

蒋介石接到咨文后，喜不自胜，即发出布告，称：“中国国民党中央监察委员会，举发共产党连同国民党内跨党之共产党员等有谋叛证据，……本总司令职司讨伐，以维护地方秩序为要，如有借端扰动，有碍治安者，定当执法。”此时的蒋介石已是磨刀霍霍，凶相毕露，只等时机一到，便向人民开刀。 陈果夫生怕蒋介石在反共决策时延误时间，他又与邓泽如、吴稚晖、张静江等人集结一起，进行密谋，决定通电全国，以敦促蒋介石把握时机，尽快反共。4月9日，陈果夫等人以国民党中央监察委员会名义发出所谓《护党救国》通电，该电文颠倒黑白地举出国共合作的武汉国民政府的所谓十一大罪状，认为这些“皆为武汉会议中所加于本党之根本之创伤，致使革命势力发皇张大之本党，有遍体创痍之观”，并耸人听闻地提出：“长此以往，不独北伐困难，而本党百万党员与朝夕以求中国的自由平等之民众，亦将何所寄托。”因此，要求国民党“全体同志念党国之危机，懔丧亡之无日，被发缨冠，共图匡济”，群起而一致反对共产党。陈果夫等的这个是非混淆的通电煽动性极强，在蒋介石叛变革命的关键时刻起了极为恶劣的作用。

这个通电发出后，以蒋介石为首的国民党反动派公开叛变革命的政治准备就完成了最后一道手续，他们武力镇压共产党的时机已完全成熟。 要将共产党斩尽杀绝，首先就要知道谁是共产党，因共产党从来没有将其党员的名单交给国民党。要分清谁是纯粹的共产党，谁是纯粹的国民党，是很困难的，蒋介石对此十分关心，要二陈想办法。 陈立夫脑袋一转，便想出一条诡计，他说：“惟一的办法便是打斗，因为一打起来，国民党的人和共产党的人自然就会分出鸿沟来，这个方法我们在安庆试过。 ”陈立夫还没说完，蒋介石便拍手叫好。于是，蒋介石命令浙江、江苏、安徽等省的亲信，组织打手，主动袭击各地工会、农会、国民党党部，以此发现共产党，然后一举清除，于是，这些地方相继出现反共逆流，白色恐怖从这些地方向全国蔓延。 为了试探武汉政府对其政变的反应，陈果夫建议，先向武汉中央军事委员会总政治部派驻上海的机构开刀。4月6日，蒋介石以总政治部人员“淆惑军心，背叛主义”等莫须有的罪名，手令白崇禧查封了总政治部上海办事处。而武汉方面漠然视之，这就使蒋介石更加肆无忌惮。

这时，上海局势十分混乱，早在上海工人第三次武装起义后，在中国共产党领导下，便组成了上海特别市临时政府，蒋介石到上海后，即于3月29日下令解散了这个革命政权，临时政府解散后，上海便成无政府状态。为了控制上海的局势，陈果夫再次向蒋介石献计，他认为，要将上海掌握在自己手中，必须尽快成立一个市政府，以取代被解散了的上海市临时政府，这不仅可以消除共产党对上海的影响，而且有利于“反共清党”的进行。蒋介石听从了陈果夫的建议，于4月8日指派陈果夫、吴稚晖、白崇禧等人成立了上海临时政治委员会，陈果夫被任命为该委员会的主要负责人之一。获此要职后，陈果夫即春风得意地走马上任，在军方的支持下，临时政治委员会成为上海市最高权力机构，“得以会议方式决定上海市一切军事政治财政之权，并指导当地党务”。这就一举篡夺了上海人民的革命果实。蒋介石也就开始屠杀共产党和革命人民了。4月12日，由蒋介石、陈果夫等发动的反革命政变开始，随后向各地蔓延，中国共产党和革命势力遭到严重摧残，中国人民蒙受了巨大的灾难。 陈果夫在四一二反革命政变中助纣为虐，为蒋介石效尽犬马之力，他的所作所为受到共产党人和国民党左派的一致反对。

4月14日，武汉国民党中央监察委员会开会，提出将蒋介石、张静江、陈果夫开除党籍。5月6日，武汉国民党中央第二届常委会第十次扩大会议讨论，通过《惩办反动分子案》，决定开除陈果夫等7人的国民党党籍。但由于共产党主要领导人陈独秀的右倾投降主义影响，再加之后来汪精卫的七一五分共，这些决议未能实现。而陈氏兄弟却在蒋家王朝中受到重用，一步一步爬上高位。