朱安在前线观察敌情

第二次世界大战全面爆发后，法国宣布与德国处于战争状态。为加强法国东北部的防御，朱安遂于1939年12月4日被调回法国本土，出任法国第1军第15摩托化步兵师师长。1940年5月10日，德军入侵卢、比、荷、法四国，朱安奉命率部前出到比利时的让布卢，抗击德军的进攻。当德军突破色当防线后，朱安率部撤到法国的瓦朗谢纳附近地域，担任掩护英法联军撤往敦刻尔克的作战任务。不久，朱安的部队又撤至里尔南郊，在此被德军包围。5月30日，朱安做了德军的俘虏。朱安的部队虽被德军打败，但他们的英勇作战行动还是为法国所称道，他的部队荣获“战斗功臣”殊荣，朱安本人于1941年2月被提升为少将。　　朱安被俘后，关押在德国柯尼希施泰因监狱。1941年6月，经魏刚将军以法国北非政府总代表的身份与德国人斡旋，朱安被德军释放了。　　1941年11月20日，朱安晋升为中将，不久受命接替魏刚的工作，担任法国驻北非陆军总司令。接任此职后，朱安扩充兵员，隐藏装备，“训练非洲军队，以用来参加未来反对轴心国的作战”。在朱安的努力下，截至1942年11月，法国在非洲的部队有5个机动师（其中阿尔及利亚有3个师，摩洛哥有2个师）和1个轻型机械化旅，共20万人。这些部队装备齐全，并在突尼斯山区设有秘密的后勤基地，战场准备也搞得不错。